Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC1A4P43007 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A4P43007 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms