Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTHFRP42898 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTHFRP42898 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms