Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFSF9P41273 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFSF9P41273 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFSF9P41273 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms