Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC5P40937 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC5P40937 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC5P40937 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC5P40937 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC5P40937 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFC5P40937 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFC5P40937 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC5P40937 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC5P40937 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC5P40937 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC5P40937 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC5P40937 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC5P40937 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFC5P40937 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFC5P40937 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFC5P40937 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFC5P40937 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC5P40937 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC5P40937 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC5P40937 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC5P40937 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC5P40937 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC5P40937 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC5P40937 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC5P40937 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC5P40937 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFC5P40937 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFC5P40937 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFC5P40937 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFC5P40937 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC5P40937 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC5P40937 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC5P40937 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC5P40937 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFC5P40937 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC5P40937 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC5P40937 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC5P40937 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC5P40937 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC5P40937 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC5P40937 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC5P40937 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFC5P40937 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFC5P40937 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms