Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX2P40425 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX2P40425 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX2P40425 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX2P40425 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PBX2P40425 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PBX2P40425 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PBX2P40425 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX2P40425 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX2P40425 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX2P40425 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX2P40425 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX2P40425 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX2P40425 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PBX2P40425 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX2P40425 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX2P40425 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX2P40425 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX2P40425 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX2P40425 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX2P40425 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX2P40425 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PBX2P40425 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX2P40425 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX2P40425 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX2P40425 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX2P40425 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX2P40425 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX2P40425 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX2P40425 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX2P40425 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PBX2P40425 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PBX2P40425 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PBX2P40425 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PBX2P40425 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PBX2P40425 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms