Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHI3L1P36222 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHI3L1P36222 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms