Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYLC1P35663 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYLC1P35663 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms