Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC8A1P32418 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC8A1P32418 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms