Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCR5P32302 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms