Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTX2P32243 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTX2P32243 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTX2P32243 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX2P32243 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX2P32243 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX2P32243 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX2P32243 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX2P32243 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX2P32243 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX2P32243 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX2P32243 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX2P32243 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX2P32243 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX2P32243 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX2P32243 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX2P32243 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX2P32243 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX2P32243 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX2P32243 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms