Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCKARP32238 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCKARP32238 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCKARP32238 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCKARP32238 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCKARP32238 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCKARP32238 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKARP32238 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKARP32238 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKARP32238 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCKARP32238 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms