Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms