Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPIFP30405 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPIFP30405 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPIFP30405 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPIFP30405 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPIFP30405 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPIFP30405 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPIFP30405 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPIFP30405 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PPIFP30405 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPIFP30405 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPIFP30405 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPIFP30405 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPIFP30405 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPIFP30405 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPIFP30405 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPIFP30405 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPIFP30405 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPIFP30405 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPIFP30405 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms