Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP2B4P23634 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms