Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4BP23588 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4BP23588 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4BP23588 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms