Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRDP23468 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRDP23468 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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