Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRBP23467 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRBP23467 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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