Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NR4A1P22736 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NR4A1P22736 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms