Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNA4P22459 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA4P22459 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms