Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATF3P18847 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATF3P18847 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATF3P18847 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ATF3P18847 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATF3P18847 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATF3P18847 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATF3P18847 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF3P18847 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF3P18847 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF3P18847 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF3P18847 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF3P18847 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF3P18847 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF3P18847 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF3P18847 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATF3P18847 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATF3P18847 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATF3P18847 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATF3P18847 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATF3P18847 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATF3P18847 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATF3P18847 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATF3P18847 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF3P18847 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF3P18847 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF3P18847 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF3P18847 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF3P18847 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF3P18847 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF3P18847 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF3P18847 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATF3P18847 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATF3P18847 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATF3P18847 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATF3P18847 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATF3P18847 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATF3P18847 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATF3P18847 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATF3P18847 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATF3P18847 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATF3P18847 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATF3P18847 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATF3P18847 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATF3P18847 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATF3P18847 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATF3P18847 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATF3P18847 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATF3P18847 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATF3P18847 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATF3P18847 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF3P18847 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF3P18847 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF3P18847 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF3P18847 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF3P18847 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF3P18847 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF3P18847 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ATF3P18847 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATF3P18847 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
ATF3P18847 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATF3P18847 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATF3P18847 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATF3P18847 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATF3P18847 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATF3P18847 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATF3P18847 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATF3P18847 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATF3P18847 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATF3P18847 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ATF3P18847 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF3P18847 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF3P18847 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF3P18847 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF3P18847 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF3P18847 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF3P18847 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF3P18847 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF3P18847 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ATF3P18847 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ATF3P18847 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATF3P18847 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ATF3P18847 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATF3P18847 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATF3P18847 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ATF3P18847 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ATF3P18847 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATF3P18847 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATF3P18847 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATF3P18847 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ATF3P18847 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATF3P18847 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ATF3P18847 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATF3P18847 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATF3P18847 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ATF3P18847 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATF3P18847 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ATF3P18847 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ATF3P18847 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ATF3P18847 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms