Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGB6P18564 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB6P18564 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms