Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRAP18433 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTPRAP18433 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPRAP18433 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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