Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARF4P18085 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARF4P18085 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARF4P18085 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARF4P18085 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF4P18085 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF4P18085 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF4P18085 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF4P18085 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF4P18085 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARF4P18085 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARF4P18085 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARF4P18085 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARF4P18085 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARF4P18085 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARF4P18085 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARF4P18085 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARF4P18085 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARF4P18085 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms