Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GM2AP17900 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GM2AP17900 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GM2AP17900 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GM2AP17900 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GM2AP17900 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GM2AP17900 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GM2AP17900 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GM2AP17900 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GM2AP17900 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GM2AP17900 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GM2AP17900 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GM2AP17900 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GM2AP17900 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GM2AP17900 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GM2AP17900 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GM2AP17900 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GM2AP17900 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GM2AP17900 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GM2AP17900 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GM2AP17900 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GM2AP17900 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GM2AP17900 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GM2AP17900 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.5 ms