Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DESP17661 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DESP17661 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DESP17661 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DESP17661 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DESP17661 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DESP17661 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DESP17661 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DESP17661 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DESP17661 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DESP17661 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DESP17661 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DESP17661 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DESP17661 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DESP17661 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DESP17661 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DESP17661 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DESP17661 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DESP17661 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DESP17661 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DESP17661 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DESP17661 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms