Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYN1P17600 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYN1P17600 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYN1P17600 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYN1P17600 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYN1P17600 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYN1P17600 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYN1P17600 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYN1P17600 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYN1P17600 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYN1P17600 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYN1P17600 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYN1P17600 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYN1P17600 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYN1P17600 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYN1P17600 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYN1P17600 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYN1P17600 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYN1P17600 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYN1P17600 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYN1P17600 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYN1P17600 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYN1P17600 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYN1P17600 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYN1P17600 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYN1P17600 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYN1P17600 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYN1P17600 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYN1P17600 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYN1P17600 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYN1P17600 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYN1P17600 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYN1P17600 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYN1P17600 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYN1P17600 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYN1P17600 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYN1P17600 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYN1P17600 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms