Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCFC2P16383 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCFC2P16383 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms