Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD44P16070 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD44P16070 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD44P16070 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD44P16070 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD44P16070 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD44P16070 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD44P16070 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD44P16070 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD44P16070 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD44P16070 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD44P16070 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms