Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAV1P15498 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAV1P15498 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAV1P15498 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAV1P15498 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAV1P15498 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VAV1P15498 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VAV1P15498 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VAV1P15498 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms