Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRAFP15056 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRAFP15056 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAFP15056 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAFP15056 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAFP15056 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAFP15056 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAFP15056 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAFP15056 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAFP15056 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAFP15056 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAFP15056 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAFP15056 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAFP15056 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAFP15056 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAFP15056 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAFP15056 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAFP15056 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAFP15056 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRAFP15056 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAFP15056 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAFP15056 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAFP15056 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAFP15056 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRAFP15056 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms