Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GP1BBP13224 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GP1BBP13224 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms