Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MS4A1P11836 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms