Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GNAT1P11488 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GNAT1P11488 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms