Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALM3P0DP25 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms