Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RGPD2P0DJD1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms