Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM13P0DJ93 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM13P0DJ93 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms