Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms