Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C4BP0C0L5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C4BP0C0L5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4BP0C0L5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4BP0C0L5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4BP0C0L5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
C4BP0C0L5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4BP0C0L5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4BP0C0L5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C4BP0C0L5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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