Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ACAA1P09110 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACAA1P09110 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms