Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT19P08727 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT19P08727 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT19P08727 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT19P08727 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT19P08727 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT19P08727 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT19P08727 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT19P08727 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT19P08727 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT19P08727 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT19P08727 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT19P08727 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT19P08727 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT19P08727 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms