Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MGPP08493 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MGPP08493 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGPP08493 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGPP08493 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGPP08493 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MGPP08493 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MGPP08493 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MGPP08493 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MGPP08493 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MGPP08493 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms