Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLK3P07288 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLK3P07288 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLK3P07288 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLK3P07288 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLK3P07288 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLK3P07288 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLK3P07288 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLK3P07288 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLK3P07288 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLK3P07288 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLK3P07288 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLK3P07288 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLK3P07288 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLK3P07288 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms