Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGAVP06756 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGAVP06756 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms