Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT6BP04259 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT6BP04259 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms