Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APBA3O96018 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APBA3O96018 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APBA3O96018 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA3O96018 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA3O96018 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA3O96018 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA3O96018 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA3O96018 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APBA3O96018 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA3O96018 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA3O96018 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA3O96018 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA3O96018 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA3O96018 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA3O96018 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA3O96018 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA3O96018 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APBA3O96018 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APBA3O96018 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APBA3O96018 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APBA3O96018 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APBA3O96018 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APBA3O96018 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
APBA3O96018 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APBA3O96018 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APBA3O96018 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA3O96018 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA3O96018 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA3O96018 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA3O96018 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA3O96018 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA3O96018 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA3O96018 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA3O96018 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APBA3O96018 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA3O96018 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA3O96018 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA3O96018 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA3O96018 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA3O96018 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA3O96018 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
APBA3O96018 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
APBA3O96018 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APBA3O96018 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APBA3O96018 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APBA3O96018 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA3O96018 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA3O96018 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA3O96018 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA3O96018 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA3O96018 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA3O96018 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA3O96018 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APBA3O96018 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APBA3O96018 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APBA3O96018 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APBA3O96018 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
APBA3O96018 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APBA3O96018 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APBA3O96018 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA3O96018 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA3O96018 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA3O96018 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA3O96018 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA3O96018 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA3O96018 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA3O96018 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA3O96018 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APBA3O96018 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APBA3O96018 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA3O96018 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA3O96018 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA3O96018 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA3O96018 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA3O96018 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA3O96018 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA3O96018 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APBA3O96018 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APBA3O96018 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APBA3O96018 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms