Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3BO95985 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms