Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTLL1O95922 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTLL1O95922 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTLL1O95922 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms