Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX58O95786 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX58O95786 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX58O95786 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX58O95786 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX58O95786 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX58O95786 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX58O95786 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX58O95786 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX58O95786 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX58O95786 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX58O95786 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX58O95786 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX58O95786 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX58O95786 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX58O95786 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX58O95786 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX58O95786 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX58O95786 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX58O95786 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX58O95786 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX58O95786 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX58O95786 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX58O95786 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX58O95786 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX58O95786 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX58O95786 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX58O95786 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX58O95786 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX58O95786 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX58O95786 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX58O95786 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX58O95786 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX58O95786 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX58O95786 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX58O95786 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX58O95786 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX58O95786 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX58O95786 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX58O95786 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX58O95786 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX58O95786 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX58O95786 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms