Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STAMBPO95630 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms