Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD4O95243 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD4O95243 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD4O95243 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MBD4O95243 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MBD4O95243 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD4O95243 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD4O95243 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD4O95243 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD4O95243 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD4O95243 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD4O95243 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD4O95243 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MBD4O95243 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD4O95243 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD4O95243 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD4O95243 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MBD4O95243 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD4O95243 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD4O95243 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD4O95243 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MBD4O95243 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD4O95243 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD4O95243 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD4O95243 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD4O95243 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MBD4O95243 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD4O95243 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD4O95243 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD4O95243 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD4O95243 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MBD4O95243 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MBD4O95243 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MBD4O95243 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD4O95243 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD4O95243 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD4O95243 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD4O95243 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD4O95243 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD4O95243 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD4O95243 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MBD4O95243 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MBD4O95243 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms